27 марта 1989 года – из аэропорта «Минск-2» выполнен первый международный рейс в Берлин. 

Республиканское унитарное предприятие «Национальный аэропорт Минск» стал правопреемником самостоятельного предприятия «Аэропорт Минск-2».

Одновременно в аэропорту было введено в эксплуатацию новейшее светосигнальное оборудование взлетно-посадочной полосы фирмы «Сименс», позволяющее осуществлять заход на посадку воздушных судов по II категории ICAO (Международная организация гражданской авиации).

В то же время была определена область распространения данной системы - предоставление услуг авиакомпаниям, пассажирам и другим клиентам в авиационной сфере деятельности, обеспечивая безопасность и регулярность полетов: обслуживание воздушных судов; обслуживание пассажиров и багажа; обработка грузов и почты; обеспечение бортовым питанием; радиотехническое обеспечение полетов; электросветотехническое обеспечение полетов; аэродромное обеспечение полетов; обеспечение спецтранспортом и средствами перронной механизации; аварийно-спасательное и противопожарное обеспечение полетов.
Уже в 2007 году по результатам аудита, проведенного международным органом по сертификации систем менеджмента TUV Thuringen, предприятие подтвердило соответствие его системы менеджмента качества требованиям международного стандарта ISO 9001.

Система обеспечивает быстрый и комфортный способ регистрации на рейс, управляет процессами как стандартной, так и самостоятельной регистрации пассажиров. Использование подобной платформы позволило аэропорту выйти на уровень международных стандартов в обслуживании авиакомпаний, помогло улучшить качество обслуживания клиентов аэропорта.

Национальный аэропорт Минск стал лауреатом Премии Правительства Республики Беларусь за достижения в области качества, а в 2014 и 2017 подтвердил звание лауреата. Предприятию вручен диплом за внедрение высокоэффективных методов управления качеством.

Национальный аэропорт Минск стал победителем конкурса «Лучший аэропорт года стран СНГ» за 2013 год, который ежегодно проводится Ассоциацией «Аэропорт» Гражданской Авиации стран СНГ.

Грузовой комплекс РУП «Национальный аэропорт Минск» был реорганизован в Транспортно-логистический центр - подразделение аэропорта, которое оказывает транспортно-экспедиционные, складские услуги, помощь в таможенном оформлении и обработке грузов.

Конец года ознаменовался важным событием в жизни Национального аэропорта Минск - завершилась реконструкция аэровокзального комплекса.

Авиапредприятие получило официальный сертификат о присуждении рейтинга «4 звезды» по результатам исследования 32 аэропортов регионов Российской Федерации и Республики Беларусь, проведенного отраслевым агентством «АвиаПорт» (Российская Федерация).

В Национальном аэропорту Минск состоялось торжественное открытие Учебного центра ICAO с участием представителей штаб-квартиры ICAO (Канада), регионального бюро ICAO (Франция), глав авиационных администраций и руководителей аналогичных центров Европейского и Североатлантического регионов, представителей министерств, руководителей авиационных организаций и служб авиационной безопасности Беларуси. Открытие 29-го по счету Учебного центра ICAO - это важнейшее достижение и подтверждение высокого профессионализма специалистов Национального аэропорта и гражданской авиации Беларуси.

Начало реализации важного проекта государственного масштаба - строительство в Национальном аэропорту Минск второй искусственной взлетно-посадочной полосы с объектами вспомогательного назначения под расчетный тип самолета А-380 с оборудованием системой точного захода на посадку III категории.
Национальный аэропорт Минск стал победителем конкурса «Лучший аэропорт стран-участниц СНГ» по итогам работы за 2017 год, который ежегодно проводится Ассоциацией «Аэропорт» Гражданской Авиации стран-участниц СНГ.
19 декабря 2017 - Национальный аэропорт Минск встретил своего четырехмиллионного пассажира.

На основании отчета аналитической компании OAG Национальный аэропорт Минск занял первое место в ТОП-20 по пунктуальности полетов за 2018 год среди всех аэропортов мира в категории «Аэропорт с количеством обслуженных пассажиров от 2,5 до 5 млн. в год». Показатель пунктуальности составил 92,35%. По итогам работы за 2019 год Национальный аэропорт Минск был также признан самым пунктуальным в мире в той же категории.

Национальный аэропорт Минск стал победителем в номинации«Лучший аэропорт стран-участниц СНГ» по итогам работы за 2018 год< с вручением Кубка и Почетной грамоты Ассоциации «Аэропорт» ГА.

Национальный аэропорт Минск – официальный Объект II Европейских Игр 2019 года в г.Минске. II Европейские игры 2019 — проходили в столице Республики Беларусь, городе Минске, с 21 по 30 июня 2019 года. В соревнованиях по 15 видам спорта принимали участие 3844 спортсмена из пятидесяти стран Европы. 

Согласно информации пограничных органов, 73% спортсменов и гостей форума прибыли через пункт пропуска «Национальный аэропорт Минск».

C 19 июня по 1 июля 2019 года аэропорт обслужил 390 101 пассажиров и 2 458 рейсов.

Кроме того, в период проведения II Европейских игр зафиксированы рекордные для авиапредприятия показатели по обслуженным самолето-вылетам и пассажирам за одни сутки:

• 208 рейсов обслужено 21 июня 2019 года
• 20 276 пассажиров обслужено 1 июля 2019 года.

23 декабря 2019 года впервые за всю свою историю Национальный аэропорт Минск обслужил 5-миллионного пассажира. Юбилейным стал пассажир, прибывший из Франкфурта рейсом LH1486 авиакомпании Lufthansa.

2 ноября 2020 года из Национального аэропорта Минск выполнен технический рейс на аэродром Орша.  Рейс осуществлен на воздушном судне Boeing 737-500 авиакомпании Belavia в рамках завершающего этапа процедуры сертификации с целью проверки готовности аэродрома к эксплуатации, а также оценки качества работы всех служб аэродромно-технического комплекса Орша. Аэродром Орша преимущественно специализируется на обслуживании грузовых рейсов.

Могилевский аэропорт вошел в структуру Национального аэропорта Минск и функционирует как его обособленный филиал с октября 2023 года. Прямое регулярное авиасообщение с Москвой (Шереметьево) было открыто 28 апреля 2025 года, с мая началось выполнение чартерной программы в Анталью (Турция).

Обновленную Республиканскую доску Почета торжественно открывают ежегодно в Минске на площади Государственного флага накануне праздника Первомая. Национальный аэропорт Минск занял свое почетное место уже в третий раз. Высокой награды аэропорт был также удостоен по итогам работы за 2021 и 2023 гг.

18 июля 2025 года Национальный аэропорт Минск получил Премию Правительства Республики Беларусь в области качества. Престижную награду, которая присуждается предприятиям за выдающиеся достижения в управлении, инновациях и безупречном уровне сервиса, Национальный аэропорт Минск получил не впервые. Звания лауреата Премии Правительства Республики Беларусь за достижения в области качества аэропорт был удостоен также по итогам 2009 года, подтвердив это почетное звание в 2014, 2017 и 2020 годах.

4 июня 2025 года Национальный аэропорт Минск стал победителем конкурса «Лучший аэропорт года» в номинации «Лучший аэропорт стран СНГ» по итогам работы за 2024 год.  Конкурс среди авиагаваней стран СНГ ежегодно проводится Ассоциацией «Аэропорт» гражданской авиации стран-участниц СНГ, членом которой минский аэропорт является с 1997 года.

6 июня 2025 года в аэропорту Минск прошла презентация нового типа воздушного судна в парке Belavia – широкофюзеляжного Airbus 330-200, что открыло новую веху как для авиакомпании, так и для гражданской авиации суверенной Беларуси в целом. Первый дальнемагистральный маршрут Belavia из Национального аэропорта Минск – Минск-Санья-Минск. Помимо рейсов в Китай, были открыты рейсы по таким направлениям, как Таиланд, Вьетнам, Шри-Ланка.

20 декабря 2026 года Минский аэропорт стал лауреатом Евразийской премии в области транспорта и логистики «Магистраль Awards-2025». Торжественная церемония вручения премии состоялась в Астане.

30 января 2026 года Национальный аэропорт Минск провел первый в истории зимний споттинг. Морозный споттинг собрал более тридцати любителей авиафотографии из Беларуси и России.

29 мая 2026 года Национальный аэропорт Минск признан лауреатом конкурса «Лучший аэропорт стран СНГ» по итогам работы за 2025 год в номинации «Динамично развивающийся аэропорт». Конкурс среди аэропортов СНГ ежегодно проводится Ассоциацией «Аэропорт» Гражданской Авиации стран-участниц СНГ, членом которой минский аэропорт является с 1997 года.